Jernej Mlekuž je raziskovalec, ki se giblje med etnologijo, geografijo, antropologijo, kulturno zgodovino, migracijskimi študijami in študijami materialne kulture. Ukvarja se z migracijami, vsakdanjim življenjem, hrano in pijačo, mediji, spominom ter nacionalizmom. Posebej ga zanimajo na videz navadne stvari, kot so burek, kranjska klobasa, slivovka in časopisni papir, skozi katere raziskuje širše družbene procese. V njegovem delu ti predmeti niso le odsev družbe, temveč dejavni soustvarjalci pripadnosti, meja, spominov in nacionalnih predstav. Najraje pa je tam, kjer teorija nima zadnje besede: na rečnih brzicah.
Jernej Mlekuž raziskuje migracije skozi vsakdanje predmete, okuse, vonje, medijske sledi, šale in materialne ostanke. Pri tem ga ne zanima le, kaj te stvari pomenijo, ampak tudi, kaj počnejo. Burek, kranjsko klobaso, slivovko, časopisni papir in druge drobne spremljevalce družbenega življenja obravnava kot dejavne soustvarjalce sveta: pomagajo oblikovati pripadnosti, meje, spomine, nacionalne predstave, razredne razlike in vsakdanje oblike oblasti.
Njegovo delo izhaja iz študij materialne kulture ter povezuje migracijske študije, antropologijo, geografijo, kulturno zgodovino in analizo medijev. Velike družbene zgodbe išče tam, kjer jih pogosto najmanj pričakujemo: v grižljaju, kozarcu, vonju, časopisnem izrezku ali mastnem madežu.
Ob raziskovanju predava na Visoki šoli za trajnostni turizem ERUDIO, ureja zbirko Migracije, predseduje Znanstvenemu svetu inštituta, mentorira ter je bil urednik znanstvene revije Dve domovini / Two Homelands.
MLEKUŽ, Jernej. 2026. Glorified Sausage: Performing the Nation among Slovenian Migrants in Interwar USA. Nationalities Papers: v tisku.
MLEKUŽ, Jernej. 2026. Bratstvo in slivovka: C₂H₅OH z zaslugami za narod. Ljubljana: Založba ZRC. Knjiga se prevaja v hrvaščino, srbščino in angleščino.
https://zalozba.zrc-sazu.si/sl/publikacije/bratstvo-in-slivovka
MLEKUŽ, Jernej. 2023. Slivovitz and Everyday Nationalism: The Analysis of Slovene Newspapers in Interwar Yugoslavia. Nationalities Papers: 1–16. doi:10.1017/nps.2023.20.
https://www.cambridge.org/core/journals/nationalities-papers/article/slivovitz-and-everyday-nationalism-the-analysis-of-slovene-newspapers-in-interwar-yugoslavia/4BE15C2A0FD0A785118D0BE13EA2D9D1
MLEKUŽ, Jernej. 2022. Kalorien und Nationalstolz. Oder wie die Krainer Wurst zur Entstehung der slowenischen Nation beitrug. Wien: LIT Verlag.
https://www.lit-verlag.de/isbn/978-3-643-91226-8
MLEKUŽ, Jernej. 2021. ABCČĆ migracij. Ljubljana: Založba ZRC.
https://isim.zrc-sazu.si/sl/publikacije/abccc-migracij#v
MLEKUŽ, Jernej. 2020. The Renaissance of Sausage: The Role of Kranjska Sausage in the Contemporary Process of Reconstructing the Slovenian Nation. Nations and Nationalism, 26/2: 407–423. doi:10.1111/nana.12572.
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1111/nana.12572
MLEKUŽ, Jernej. 2020. The Sausage That Awakened a Nation: The Carniolan Sausage in the Slovenian National Imagination, 1849–1918. Rethinking History, 24/3–4: 503–522. doi:10.1080/13642529.2020.1831352.
https://www.tandfonline.com/doi/pdf/10.1080/13642529.2020.1831352?needAccess=true
MLEKUŽ, Jernej. 2020. Pijača z zaslugami za narod: slivovka in banalni nacionalizem v izbranem časopisju socialistične Jugoslavije. Traditiones, 49/3: 115–134. doi:10.3986/Traditio2020490306.
https://ojs.zrc-sazu.si/traditiones/article/view/9432/8537
MLEKUŽ, Jernej. 2017. Kranjsko klobasanje: Slovenska zgodovina, kot jo pišejo packe kranjske klobase na časopisnem papirju. Ljubljana: Beletrina.
https://beletrina.si/knjiga/kranjsko-klobasanje
MLEKUŽ, Jernej. 2015. Burek: A Culinary Metaphor. Budapest; New York: Central European University Press.
https://www.ceu.edu/article/2015-09-22/burek-culinary-metaphor
- Made in YU: Kako so neljudje gor spravili Jugoslavijo (raziskovalni projekt • 01. januar 2020 - 31. december 2022)
- Zamišljena materialna kultura. O širjenju nacionalizma v družbi materialne kulture (01. julij 2011 - 31. december 2015)
- Predava na Visoki šoli za trajnostni turizem ERUDIO in mentorira študente.
- Knjiga Burek: A Culinary Metaphor (CEU Press, 2015) je bila na tekmovanju Gourmand International Best of the Best 1995–2025 izbrana za najboljšo knjigo tridesetletja v kategoriji Food Culture, Cascais, Portugalska (2025).
- Odlični v znanosti, področje Narodno vprašanje, ARRS, za članek, objavljen v reviji Rethinking History (2021).
- Odlični v znanosti, področje Narodno vprašanje, ARRS, za članek, objavljen v reviji Nations and Nationalism (2020).
- Knjiga Kranjsko klobasanje je bila na tekmovanju Gourmand Best in the World izbrana za najboljšo knjigo v kategoriji Culinary History (2018).
- Murkovo priznanje za izstopajoče dosežke, Slovensko etnološko društvo (2018).
- Knjiga Burek: A Culinary Metaphor je bila na tekmovanju Gourmand Best in the World izbrana za zmagovalno knjigo v kategoriji Best Food Writing (2016).
- Odlični v znanosti, področje Kulturologija, ARRS, za soavtorstvo knjige Going Places (2015).
- Odlični v znanosti, področje Narodno vprašanje, aplikativni dosežek, ARRS, za uredništvo revije Dve domovini / Two Homelands (2014).
- Odlični v znanosti, področje Narodno vprašanje, ARRS, za članek in knjigo o bureku (2012).
- Štipendija ZRC SAZU za perspektivne raziskovalce, 3 meseci, Department of Social Anthropology, University of Bergen, Norveška (2001).
- Predseduje Znanstvenemu svetu inštituta.