Jure Gombač raziskuje na presečišču kritičnih migracijskih študij, kritičnih državljanskih študij in kritičnih mejnih študij. Trenutno ukvarja z raziskovanjem materialnosti na balkanski poti,  nedokumentiranimi migracijami skozi države nekdanjih Jugoslavij ter s situacijo oseb z začasno zaščito. Preko različnih mednarodnih in  nacionalnih projektov se posveča tudi vključevanju ljudi,  ki jih države, meje, administrativni postopki, politike in diskurzi ustvarjajo kot »migrante«, v družbo in na trg dela.

Sodeluje z različnimi raziskovalnimi skupinami v Nemčiji, Avstriji, Italiji, na Norveškem, Hrvaškem in v ZDA. Sodeluje na mednarodnih konferencah ter v okviru delavnic, okroglih miz, predavanj ter drugih oblik podajanja vsebine skuša nagovarjati teme kot so človekove pravice, interkulturni dialog, inkluzija, raznolikost, migracije, meje, solidarnost.

Objavlja znanstvene in strokovne članke v domačih in tujih znanstvenih in strokovnih revijah. Predava na Univerzi v Novi Gorici ter Podiplomski šoli ZRC SAZU.

BEZNEC, Barbara, GOMBAČ, Jure. (2023). New migration policies and innovative practices : Slovenia between bordering and inclusion. Innovation : the European journal of social science research. 2023, vol. 36, no. 2, str. 250-265

KLUN, Lucija, ALALI, Alaa, GOMBAČ, Jure. (2022) Vključevanje v vzgojno-izobraževalni sistem iz perspektive staršev in otrok beguncev. Dve domovini : razprave o izseljenstvu. [Tiskana izd.]. 2022, [št.] 56, str. 149-168. 

MORAD, Mohammad, GOMBAČ, Jure. (2018). "Probashi" in Italy : new destinations : trends, origins and profiles of Bangladeshi migrants in Padova and Cadoneghe. Dve domovini : razprave o izseljenstvu. [Tiskana izd.]. 2018, [št.] 47, str. 37-52, ilustr

GOMBAČ, Jure. (2017). The role(s) of borders in EU "migration management". V: ZENNER, Hans-Peter (ur.), ŠELIH, Alenka (ur.). Human rights and refugees. Halle (Saale): Deutsche Akademie der Naturforscher Leopoldina - Nationale Akademie der Wissenschaften; Stuttgart: Wissenschaftliche Verlagsgesellschaft, 2017. Neue folge, nr. 415, str. 17-22. Nova acta Leopoldina, Neue Folge, Nr. 415. 

GOMBAČ, Jure. (2016) "Ogromno delo, uspešno, vzorno!" : "upravljanje" mej v Sloveniji v času povečanega prihoda migrantov 2015/2016. Časopis za kritiko znanosti. 2016, letn. 44, št. 264, str. 72-83. 

GOMBAČ, Jure. (2024). Augusto Boal in the asylum home : theatre of the oppressed for social entrepreneurship. V: BIANCHINI, Stefano (ur.), BANDINI, Federica (ur.), BOLZANI, Daniela (ur.). Social entrepreneurship and migrants' inclusion : insights from the Adriatic-Ionian region. Cham: Palgrave Macmillan, cop. 2024. Str. 175-198. Sustainable development goals series 

PEHAR, Asja, GOMBAČ, Jure. (2021). "It is not too bad in Slovenia, but it could be much better" : inclusion of asylum seekers and refugees at the borders of Europe. V: BUFON, Milan (ur.), MALLOY, Tove H. (ur.), WILLIAMS, Colin H. (ur.). Societies and spaces in contact : between convergence and divergence. Berlin: P. Lang, cop. Str. 169-182. Studies in European integration, state and society, vol. 11.

VIŽINTIN, Marijanca Ajša, MILHARČIČ-HLADNIK, Mirjam, GOSTIČ, Maja, GOMBAČ, Jure, LUKŠIČ-HACIN, Marina. (2025). Vključevanje in delo z otroki priseljenci v vrtcih in šolah v Sloveniji: analiza stanja : končno raziskovalno poročilo. Ljubljana: ZRC SAZU, Inštitut za slovensko izseljenstvo in migracije, 2025

AZHIEVSKA, Ivana, GOMBAČ, Jure, KASTELIC, Špela, PEHAR, Asja, PERACHINO, Susanna (2024). Collaborative spaces: a perspective on inclusivity : RES-MOVE. [Ljubljana: ZRC SAZU], 2024. 105 str.

AZHIEVSKA, Ivana, GOMBAČ, Jure, GOSTIČ, Maja, KASTELIC, Špela. (2024) Multi-sector needs assessment : Slovenia 2023 : UNHCR final report. Ljubljana: Slovenian Migration Institute, ZRC SAZU. 

• JOINT-UA-EMPLOY (aplikativni projekt • 01. september 2025 - 01. marec 2027)
• Stanovanjska pravičnost: sponzorstva za premagovanje nestabilnih stanovanjskih razmer za migrante v Evropi (H:OUSE) (01. marec 2024 - 28. februar 2027)
• RES-MOVE - Znanje na poti (01. marec 2024 - 28. februar 2027)
• GEtCoheSive - Izboljšanje upravljanja za sožitje družb (mednarodni projekt • 01. april 2023 - 31. marec 2026)
• Biografije istrskih poti: hoja in pisanje kot metodi raziskovanja obmejnih prostorov (temeljni raziskovalni projekt • 01. oktober 2022 - 31. december 2025)
• Prevajanje kulturnega jezika za vključevanje migrantov - TOCL (01. april 2022 - 29. februar 2024)
• Opolnomočenje migrantov za aktivno predstavništvo v skupnosti - EMBRACE (01. januar 2022 - 31. december 2023)
• Razvoj vključujočih poti za integracijo žensk migrantk - ENGAGE (01. februar 2021 - 31. marec 2023)
• Spodbujanje sodelovanja evropskih državljanov pri izboljšanju obravnave mladoletnikov brez spremstva – SHADOW GAME (03. januar 2021 - 31. avgust 2022)
• Union Migrant Net (UMN) (01. december 2019 - 28. februar 2023)
• SIforREF - Vključevanje beguncev v družbo in na trg dela skozi družbeno inovacijo (mednarodni projekt • 01. april 2019 - 31. marec 2022)
• Le z drugimi smo (aplikativni projekt • 13. maj 2016 - 30. september 2021)
• BEST – Spodbujanje podjetniških veščin kot orodje za vključevanje migrantov na trg dela (aplikativni projekt • 01. februar 2019 - 31. julij 2021)
• PandPAS (mednarodni projekt • 01. december 2017 - 30. november 2019)
• URBAN DIVERSITY (Urbana raznolikost) (mednarodni projekt • 01. maj 2017 - 30. april 2020)

• Srebrni znak ZRC SAZU

• Član Slovenskega sociološkega društva
• Član IMISCOE
• Član Odbora za spremljanje programa sklada za azil, migracije in vključevanje, programa sklada za notranjo varnost in programa instrumenta za finančno podporo za upravljanje meja in vizumsko politiko v okviru sklada za integrirano upravljanje meja v programskem obdobju 2021-2027